بررسی مقایسه ای پروفایل پروتئینی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس- فایل ۱۶ |
![]() |
۱۱۷۳-P2 (1961) By: Augier
۱۱۷۳-P2 LotC 84 (1984) By: Gheorghiu
۲-۲۱-۴. ایمنیزایی
بیش از ۷۵ سال از مصرف واکسن BCG میگذرد و تا کنون میلیونها دز از آن به نوزادان و کودکان در سراسر دنیا تزریق شده است، ولی مکانیزم مصونیت آن در برابر بیماری سل و تاثیر آن بر سیستم ایمنی ناشناخته است.
با درک مکانیزم ایمنیزایی BCG نه تنها طراحی واکسنهای جدید تسهیل می شود بلکه بر اساس آن میتوان تستهای سریع جهت مصونیت حاصل از انواع واکسنها را نیز پایهگذاری کرد. یکی از علل کارآیی (efficacy) بسیار متغییر واکسن BCG در پیشگیری از بیماری سل می تواند تفاوت پاسخهای ایمنی القا شده توسط BCG با پاسخهای مورد نیاز جهت دفاع موثر علیه سل باشد .(Colditz G.A. et al., 1994) لذا درک مکانیسم ایمنیزایی واکسن BCGو مقایسه آن با جنبه ایمونولوژیک بیماری سل بسیار حایز اهمیت است.
یک ویژگی مشترک BCG M. bovis و M. tuberculosis زیستگاه داخل سلولی آنها است، به گونه ای که زیستگاه هر دو باکتری در بدن میزبان سلولهای ماکروفاژ بوده و هر دو باکتری میتوانند داخل این سلولها زنده مانده و تکثیر نمایند و در نهایت عفونت ایجاد کنند. طی عفونت ناشی از BCG M. bovis اغلب باکتری ها توسط ماکروفاژهای فعال شده از بین رفته و تنها تعداد اندکی از باکتری ها داخل فاگوزوم ماکروفاژها باقی مانده و باعث عفونت مزمن بدون علایم بالینی میشوند. لنفوسیتهای T مسئول فعالسازی ماکروفاژها از نوع CD4 بوده و نقش کلیدی آنها در پاسخ به عفونت BCG به اثبات رسیده است. عفونت با این باکتری موجب القا ترشح IFN توسط T CD4 اختصاصی آنتیژن می شود. IFN در زمینه عملکردهای ضد مایکوباکتریایی ماکروفاژهای فعال شده دخالت دارد و توسط سلولهای T CD4 نیز به میزان کمتر تولید می شود. عملکرد دیگر سلولهای T CD4 فعالیت سیتولیتیک آنها است. بر اساس مطالعات انجام شده بر روی موشهای دارای نقایص ژنتیکی در عملکرد سلولهای T CD4 وT CD8 مشخص شدهاست که سلولهای T CD4 جهت کنترل عفونت ناشی از M. bovis BCG طی ماههای اول عفونت ضروری و کافی است. به هر حال سلولهای T CD8با تعداد زیاد هم میتوانند در ایجاد مقاومت نسبت به این عفونت دخالت داشته باشند (Rook G.A and Stanford J.L., 1996).
بنابراین کنترل عفونت BCG M. bovis تا حد زیادی وابسته به سلولهای T CD4 بوده که با تولید سایتوکاینهای خاص عملکردهای ضد مایکوباکتریایی ماکروفاژها را موجب می شود.
بر خلاف BCG در مورد M. tuberculosis باید گفت که فعال شدن ماکروفاژها به تنهایی برای دفاع علیه این باکتری کافی نیست. به مانند عفونت BCG M. bovis فعالیت ماکروفاژهای ناشی از عملکرد سلولهای T CD4 و به میزان کمتری در اثر سلولهای T CD8 است ولی M. tuberculosis توانایی غیر فعال کردن ماکروفاژها با مکانیزم های مختلفی را دارا است. این باکتری با تولید آمونیاک و سولفاتیدها موجب مهار ادغام فاگوزوم و لیزوزوم می شود. از طرفی باسیل سل با سوء استفاده از گیرندههای کمپلمان (CR1 , CR3) برای جذب و نیز به اتصال با گیرندههای فیبرونکتین و ویکرونکتین پدیده انفجار اکسیداتیو را مختل می کند. ترکیبات دیواره سلولی مایکوباکتریها اثرا سایتوکاینی را تغییر داده و نیز در تولید واسطههای فعال اکسیژن (ROI) اختلال ایجاد مینماید. سایر عملکردهای افکتوری ماکروفاژها نیز تحت تاثیر این باکتری قرار میگیرد.
بنابراین جهت مصونیت مطلوب در برابر عفونتهای M. tuberculosis نابودی ماکروفاژهای آلوده الزامی است تا باکتری ها توسط ماکروفاژهای کارا بلعیده شوند. سلولهایی که ماکروفاژهای غیر غعال را نابود می کنند احتمالا لنفوسیتهای T سایتولتیک هستند. پاسخ سایتولیتیک عمدتا توسط سلولهای T CD8 ابراز می شود و مواردی از این پاسخها بصورت اختصاصی علیه مایکوباکتریها نیز گزارش شده است.
بر اساس مطالعات انجام شده سلولهای T CD8 در ایجاد مصونیت نسبت به M. tuberculosis بایستی ایفای نقش کنند. در نتیجه ایجاد مصونیت مبتنی بر سلولهای T بوده که در آن تولید IFN توسط سلولهای T CD4 با عملکرد سایتولیتیکهای سلولهای T CD8 همراه می شود.
۲-۲۱-۵. لزوم طراحی واکسن جدید
واکسنی که در حال حاضر برای مقابله با بیماری سل به کار میرود، واکسنی است که از سویه زنده ضعف شده مایکوباکتروم بوویس تهیه می شود. این واکسن به خوبی قادر است با مننژیت سلی نوزادان و با توجه به محیط در مواردی با سل ریوی مقابله کند .(Rook GAW.et al., 2001) ولی آیا این واکسن به اندازهای ایمنی در برابر بیماری سل میدهد که ما را بینیاز از یافتن واکسن جدید کند؟ واقعیت این امر است که با توجه به گزارشهای مختلف در سطح جهان می تواند این طور استنباط کرد که کارآیی این واکسن در برابر سل ریوی و یا عود مجدد بیماری از ۸۰ تا صفر درصد متغییر است .(Fine PEM., 1993)
پارهای از معایب واکسن ب ث ژ به قرار ذیل هستند :
عدم حفاظت کامل در برابر سل تنفسی بزرگسالان (فقط ۵۰% از افراد واکسینه شده در برابر فعال شدن مجدد سل مقاومت نشان می دهند)
استفاده از این واکسن، به دلیل قرابت آنتیژنیک با باسیل مولد بیماری در تست بیماری توبرکولین که برای ردیابی بیماری سل استفاده می شود، ایجاد اشکال می کند.
درصورتیکه فرد با مایکوباکتریومهای محیطی برخورد کرده باشد، به دلیل فعال شدن سیستم ایمنی بر علیه آنها و قرابت آنتیژنیک این باسیلها با مایکوباکتریوم بوویس ب ث ژ، سیستم ایمنی بر علیه آنها فعال شده و در صورت تزریق واکسن، باسیل مورد استفاده در واکسن به واسطه مقابله سیستم ایمنی از بدن حذف شده و ایمنی ایجاد نمی شود .(Stanford J.L. et al., 1981)
باسیل استفاده شده در این واکسن زنده بوده و در صورت استفاده در فرد دچار ضعف سیستم ایمنی می تواند خطرساز باشد.
در مناطق استوایی به دلیل آلودگی افراد با کرمها و انگلها، پاسخ قوی Th2 در پاسخ به عفونت ایجاد می شود که از پاسخ میزبان به واکسن ممانعت نمود و ایمنی ایجاد نمی شود (Rook G.A.W.et al., 2001).
استفاده از دوز بالای ب.ث.ژ باعث ایجاد پاسخهای Th2 می شود.
روش استفاده از واکسن به دلیل تزریقی بودن، تهاجمی میباشد.
۲-۲۲. پروتئومیکس مایکوباکتریومها
نیاز روز افزون در شناخت ماهیت، چگونگی و روش عملکرد محصول ژنها، یعنی پروتئینها، منجر به ظهور پروتئومیکس (Proteomics) گشته است. پروتئومیکس به بررسی محتوای پروتئینی و یا پروتئوم (Proteome)، یک سلول یا بافت و یا مایع فیزیولوژیک در شرایط تکاملی، محیطی و یا آسیب شناسی مشخص می پردازد .(Beranova-Giorgianni S., 2003) از دیدگاه بیوشیمیستها پروتئومیکس، مطالعه بیش از یک پروتئین در یک زمان خاص است. کلمه پروتئوم نخستین بار در سال ۱۹۹۴ برای توصیف مجموعهای ازپروتئینها که توسط یک ژنوم کدگذاری شدهاست، ابداع شد.
پروتئومیکس کاربردهای زیادی دارد، عمدهترین کاربردها در این زمینه عبارت است از:
-تشخیص بیماریهای عفونی و بیماریهای مشترک انسان و دام
-تشخیص زودرس بیماریهای بدخیم
الکتروفورز دو بعدی (Two Dimensional Electrophoresis, 2DE) یکی از رایجترین و قدرتمندترین روشهای جداسازی پروتئینها بخصوص در پروتئومیکس است. این روش در حدود سی سال پیش با بهره گیری از تفاوت موجود در دو خصوصیت ذاتی پروتئینها، یعنی بار الکتریکی و وزن مولکولی، ابداع شده است .( Reddy K and Perrotta P., 2004) روشهای نوین و جایگزین دیگری برای جداسازی پروتئینها ابداع شده اند، مانند استفاده از فناوریهای ریزسیالها (Microflouidics) و چیپس (Chips)، استفاده از فناوری چند بعدی در تعیین هویت پروتئین (Multidimensional protein identification technology, MudPIT) که بر پایه کروماتوگرافی مایع دوبعدی قرار دارد، آنالیز مسقیم مخلوطهای پروتئینی با طیف سنجی جرمی(Mass spectrometry, MS)، استفاده از برچسبهای با میل ترکیبی اختصاصی (Affinity tags)، و غربالگری توسط روش ” مخمر-دو هیبرید” (Yeast-two hybrid) در مقیاس بالا (Graves P.R. and Haystead T.A.J).
امروزه تفکیک پروتئینهای بافتها توسط روشهای الکتروفورز دوبعدی، SDS-page و شناسایی آنها توسط طیفسنج جرمی میسر است .( Wittmann_Liebold B. et al., 2006) استفاده از روش SDS-page در تخمین وزن مولکولی پروتئینها اولین بار توسط Shapivo و همکارانش در سال ۱۹۶۷ گزارش گردید و بعدها در ۱۹۶۹ محققینی با نامهای weber و Osborn این تجزیه را تایید کردند و سرانجام توسط laemmli در ۱۹۷۰ به شکل امروزی جهت تعیین وزن مولکولی پروتئینها در آزمایشگاههای تحقیقاتی تبدیل گردید.
پروتئینهای طبیعی دارای بار الکتریکی، وزن مولکولی و شکل فضایی متفاوتی هستند و این عوامل در حرکت الکتروفوریتکی پروتئینها موثراند. Weber و Osborn نشان دادند که الکتروفورز ژل پلیآکریلآمید در حضور دترخبت یونی سدیمدودسیلسولفات یا لوریلسولفات یکی از کارآمدترین روشها برای تعیین وزن مولکولی پروتئینهای نمونه میباشد .( Wittmann_Liebold B. et al., 2006)
این روش ضمن ساده بودن به میزان اندک نمونه جهت آزمایش نیاز دارد و دارای قدرت تفکیک مناسب جهت شناسایی و تعیین خلوص پروتئینهاست.
بطور کل پروتئینها متنوعترین ماکرومولکولها در سیستمهای زنده هستند. بنابراین عملکردهای بسیار مهمی در تمام فرایندهای زیستی بر عهده دارند، پارهای از عملکردهای پروتئینها به قرار زیر است:
پروتئینها به عنوان کاتالیزور عمل می کنند و فرایندهای متابولیکی را در سلول انجام می دهند.
پروتئینها عمل ساختاری در داخل و خارج از سلول دارند.
پروتئینها در یک سلول ممکن است به عنوان پیام (signal) ترشح شده و در بخشهای خارج سلولی(extracellular) ذخیره شوند، سپس توسط سلولهای دیگر شناسایی شوند.
آنها به عنوان گیرنده (receptor) باعث انتقال اطلاعاتی از قسمت های خارج سلول به داخل سلول میشوند.
آنها ممکن است به صورت ترکیبات پیامرسان داخل سلولی (intracellular) عمل کنند و روی گیرندهها اثر بگذارند.
پروتئینها ترکیبات اصلی ماشین بیان ژن هستند و تعیینکننده بیان ژنهای بخصوصی میباشند. آنها در ترجمه mRNA ها به پروتئینها دخالت دارند.
آنها در انجام عمل همانندسازیDNA، برش RNA(splicing) و پیرایش (editing) دخالت دارند.
پروتئومM. tuberculosis در سال ۲۰۰۴ به طور کامل مشخص شد. جداسازی پروتئینهای مختلف چندین سویه از باکتری مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به وسیله الکتروفورز پس از قرارگیری پروتئینهای حاصله بر روی باندها و شناسایی پروتئینهای حاصله نشان داده است که این پروتئینها به چند گروه تقسیم میشوند.
گروه اول، پروتئینهای متابولیسمی میباشند که در فرایندهایی شامل متابولیسم کربوهیدراتها، لیپیدها، زنجیره تنفسی و فسفریلاسیون اکسیداتیو نقش دارند. این گروه از پروتئینها در دیواره سلولی باکتری قرار دارند و شامل زنجیره بتا سنتز آدنوزین مونوفسفاتاند. در این گروه ناقلهای الکترون بیشترین میزان پروتئینها را بر روی ژل نشان می دهند.
گروه دوم، شامل پروتئینهای تنظیمیاند که ساختار شیمیایی تعریف شدهای دارند. به عنوان مثال متوقف کننده رونویسی(NUSG ) و تنظیم کنندههای متانول (MOXR).
گروه سوم، شامل آنتی ژنهای HSPXاند که برای دوام و بقاء باسیل ضروریاند.
پروتئینهای ترشحی[۶۶] و سطحی نقش به سزایی در برانگیختن ایمنی سلولی موثر و تشخیص TB را دارند. فیلترهای کشت M. tuberculosis حاوی آنتیژنهای مختلفی میباشد .بسیاری از آنها با بهره گرفتن از آنتیبادیهای منوکلونال شناسایی شده و مورد بررسی قرار گرفتاند. بسیاری از این آنتیژنها، پروتئینهای ترشحی موجود دردیواره باکتری و یا پروتئینهای رها شده از جسم باکتری های مرده هستند که قادر به ایجاد پاسخ ایمنی در مراحل ابتدایی ایجاد عفونت در بیمار میباشد (Sonnenberg M.G. and Belisle J.T., 1997). پروتئینهای ترشحیM. tuberculosis تا به امروز به شکل گستردهای مورد بررسی قرار گرفتهاند و مشخص شده است که این آنتیژنها قادر به القای پاسخ ایمنی در حیوانات آزمایشگاهی میباشند .(Uma Devi K.R. et al., 2002)
از جمله این پروتئینهای میتوان به موارد زیر اشاره کرد:
پروتئین regx3 که در واقع جزء سیستم تنظیمکننده دو جزئی میباشد باشد و در ویرولانس نقش دارد و ۵۰ ژن تحت تاثیر این پروتئین قرار دارند.
پروتئینهای دخالت کننده در واکنشهای اکسید و ردوکتاز که از پروتئین غشایی میباشد. نشان داده شده است که بیان این پروتئینها در دو سویهM. tuberculosis و ب.ث.ژ متفاوت است و این پروتئینها قبلا به عنوان کاندید واکسنی مطرح شده بودند.
پروتئین wag3 که در واقع یک آنتیژن و همولوگ پروتئین سلولی است و در واقع سوبسترای آنزیم PKnA و PKnB می باشد که در تقسیم سلولی نقش دارد.
پروتئین OPCA که شبیه آنزیم گلوکزدهیدروژناز میباشد.
پروتئین FixB که در واقع زیر واحد آلفای فلاوپروتئین میباشد در نقل و انتقال الکترون نقش دارد.
پروتئینهای بسیار متغیر PE-PGRSو PPE-MPTR که یکی از بزرگترین منابع تغییرات آنتی ژنیکی در این باکتریاند که دو خانواده ژنی مهم (PPE, PE) درM. tuberculosis مسئول کد گذاری این پروتئینها میباشند. ولی قسمت-C-ترمینال به صورت متغیر میباشد و انتهای آن از ۱۴۰۰-۱۰۰ اسید آمینه تشکیل شده است. این نامها ازموتایفهای Pro-Glu(PE) (به تعداد ۹۹ اسید آمینه) و Pro-Pro-Glu(PPE) (به تعداد ۶۸ اسید امینه) در انتهای N ترمینال پروتئینهای PPE,PE ناشی می شود که به صورت حفاظت شده و شکل حاصل از آن کروی میباشد. عمل این پروتئینها مشخص نشده است، ولی پروتئینهای آنها حاوی توالیهای تکراری از اسیدهای آمینه خاص در C ترمینال میباشند. محصولاتی مثل Mtb41 , Mtb39a که وابسته به این پروتئینهااند، اهدافی برای سیستم ایمنی اند که میتوانند به عنوان کاندیدی برای واکسن باشند (Delogu, G. and Brennan M.J., 2001).
کمپلکس آنتیژنی ۸۵ که این کمپلکس پروتئینی از سه پروتئین مجزا با همولوژی بالا به نامهای ۸۵C ,85B ,85A و یا FbpC2 ,FbpB ,FbpA تشکیل شده است که هر کدام دارای وزن مولکولی نزدیک به ۳۰ کیلو دالتون میباشند. فعالیت مایکولیل ترانسفرازی در ساخت دیواره باکتری و در بیوسنتز فاکتور طنابی شدن دارد (Dheenadhayalan V. et al., 2002). این پروتئینها به وسیله ۳ ژن جداگانه کد شده و از لحاظ توالی (۹۸-۶۸ درصد) شباهت دارند. این آنزیم جزو فراوان ترین پروتئینهای ترشحی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس است که در مرحله اولیه بیماری ترشح می شود و به فراوانی در ماکروفاژهای آلوده به این باکتری یافت می شود. به تازگی مشخص شده است که پروتئینc از این کمپلکس در اتصال کووالانسی اسید مایکولیک به آرابینوگالاکتان (Arabinogalactan) ، نقش مهمی دارد. آنتیژنهای غالب در پاسخ های سلولهای CD8+T و CD4+T میباشند.
آنتیژن MPB51 که یکی از پروتئینهای اصلی ترشحی میباشد که با سه جزء کمپلکس آنتیژنی ۸۵ واکنش متقاطع داشته و از نظر ساختمانی نیز ۴۳ درصد با جزء مایکولیل ترانسفراز آنها تشابه دارد.
آنتیژن MPT64 که دارای وزن مولکولی ۲۴ کیلو دالتون میباشد .(Marzouk M. et al., 2011)
خانواده آنتیژنی ESAT-6 که دارای وزن مولکولی ۶ کیلو دالتون بوده که شامل یک دسته عمومی پروتئین در خانواده اکتینوباسیلوسها میباشند که عمل طبیعی آنها هنوز مشخص نشده است ولی گمانه زنیهایی مبنی بر ویرولانس فاکتور بودن وجود دارد. علارقم عدم وجود توالی رهبر برای ترشح پروتئین ESAT6، این پروتئین یکی از اجزاء غالب و قوی فیلترهای کشت مایکوباکتریومی است که بسیار آنتیژنیک میباشد. CFP-10 کمپلکس این خانواده آنتیژنی است با وزن مولکولی آن ۱۰ کیلو دالتون است .(Farshadzadeh Z. et al., 2010)
آنتیژنهای ترشحی توسط باکتری M. tuberculosis سالیان متمادی است که به عنوان هدف در طراحی داروهای ضد مایکوباکتریومی بخصوص کاندیدای واکسن مورد توجه قرار گرفتهاند. به تازگی با متدهای بیوانفورماتیک ۵۲ پروتئین به عنوان آنتیژن ترشحی شناخته شده اند.
فرم در حال بارگذاری ...
[چهارشنبه 1400-07-28] [ 02:17:00 ب.ظ ]
|